Service de Laboratoire de Microbiologie
La Microbiologie est une discipline transversale présente à toutes les étapes de la chaîne de soins, du diagnostic au suivi des pathologies infectieuses et des traitements, en passant par la prévention et le dépistage. Elle nécessite une large communication avec les autres prestataires de soins et le microbiologiste doit se placer en partenaire du médecin, l'orientant et le guidant dans sa pratique quotidienne.
Secteur d'activités du laboratoire de microbiologie
Le Laboratoire de Microbiologie situé à l’Hôpital ARRAZI est un laboratoire central qui répond aux besoins en Bactériologie, en Virologie et en Biologie moléculaire des hôpitaux suivants:
- Hôpital Mère Enfant
- Hôpital des spécialités Arrazi
- Centre d’oncologie Hématologie
- Hôpital Ibn Nafis
- Hôpital Ibn Tofail (Prestations non disponibles au laboratoire de l’Hôpital Ibn Tofail)
- Examen direct
- Cytologie
- Culture
- Antibiogramme Tout site infectieux
- Recherche de BK par examen direct
- Culture du Milieu liquide (MGIT) et milieu gélosé (Lowenstein Jensen)
- Bacillogramme
- Sérologie TPHA - VDRL sur le sang et le LCR
- Recherche des virus suivants sur le sang : Hépatite A - Hépatite B - Hépatite C - VIH – HTLV – CMV – EBV – Rubéole
- Test respiratoire à l’urée marquée pour la recherche de l’Helicobacter pylori
- PCR spécifiques pour la détection et la quantification du VIH
- PCR spécifiques pour la détection et la quantification du Virus de l’hépatite C
- PCR multiplex pour SARS Cov-2, VRS, Grippe A et B
- PCR SARS Cov-2
- PCR syndromique multiplex
- Méningites et méningo encéphalites
- Gastro intestinal
- Respiratoire – Pneumoniae
- Sepsis
- Ostéo articulaire
- Collaboration étroite avec les infirmiers hygiénistes du CHU
- Anticipation des épidémies en déclenchant précocement les alertes au niveau des services concernés
- Enquêtes au niveau de l’environnement et prélèvements des surfaces et des équipements pour déterminer les sources de contamination
- Contrôle microbiologique du bionettoyage au niveau des blocs opératoires et des réanimations
- Contrôle microbiologique des équipements endoscopiques
- Surveillance des Bactéries Multirésistantes par secteur d’activité, par site infectieux et selon les années
- Participation aux enquêtes de prévalence de l’infection nosocomiale au sein du CHU
- Communication des rapports au CLIN
Techniques innovantes et un plateau technique performant
Le Laboratoire de Microbiologie de l’Hôpital ARRAZI, dispose d’un plateau technique très performant automatisé répondant aux normes de qualité avec des installations et des équipements de dernière génération permetant le développement d’examens spécialisés de qualité et de bonne technicité au bénéfice des patients. Ce plateau technique permet de répondre en continu et dans les meilleurs délais aux attentes et aux prestations des cliniciens et leur offrir ainsi tous les outils innovants leur permetant d’assurer un diagnostic rapide des maladies infectieuses et une meilleure prise en charge thérapeutique de nos patients.
- Automatisation des techniques de l’antibiogramme : Antibiogramme rapide et CMI automatisées et par micro dilution
- Identification bactérienne par Spectrométrie de masse Maldi TOFF
- Cytologie urinaire et cytologie des liquides biologiques automatisée par Cytométrie en flux
- Incubation automatisée des hémocultures
- Outils de Diagnostic rapide de détection des gènes de résistance
- Tests rapides immunochromatographiques
- PCR syndromiques multiplex
- Plateforme de sérologie virale
- Plateforme de Biologie moléculaire
Prestations du laboratoire de microbiologie sur les dernières années
| Prestations / Nombre de tests réalisés | 2017 | 2018 | 2019 | 2020 | 2021 | 2022 | 2023 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Examens bactériologiques standards tout site infectieux confondu | 19465 | 25658 | 32155 | 22430 | 29546 | 34000 | 37700 |
| Sérologies virales et bactériennes | 28074 | 43024 | 52751 | 35945 | 59015 | 66000 | 68532 |
| Recherche de BK | 2042 | 2652 | 2023 | 590 | 2053 | 5327 | 5714 |
| Tests de PCR | 804 | 1428 | 2300 | 2750 | 2438 | 3356 | 4500 |
| PCR COVID-19 | --- | --- | --- | 138000 | 89900 | 21135 | 3937 |
Participation à des missions de la sante publique
| Activité d’ouverture | Statut |
|---|---|
| Enquête de Prévalence de l’infection nosocomiale au CHU de Marrakech 2017 | Participation à la :
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| Enquête de Prévalence de la Consommation des Antibiotiques au CHU de Marrakech 2017 | Participation à la :
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Enquête nationale sur la Séro- Prévalence de l’infection par le virus SARS-Cov2– 2020
Au niveau de la Région de Marrakech Tensift El Haouz et les donneurs de sang En collaboration avec le Ministère de la Santé publique |
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Enquête nationale sur la Séro- Prévalence de l’infection par le virus SARS-Cov2 – 2022 pour évaluer la réponse post vaccinale
Au niveau de la Région de Marrakech Tensift El Haouz et les donneurs de sang En collaboration avec le Ministère de la Santé publique |
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Membre du Réseau national de Surveillance de la Résistance aux antimicrobiens (GLASS de l’OMS)
En collaboration avec le Ministère de la Santé publique |
Participation à :
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Programme national de la Surveillance annuelle de la grippe saisonnière
En collaboration avec le Ministère de la Santé publique |
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Programme national du Diagnostic du VIH et de la surveillance virologique du VIH chez les patients VIH positifs pris en charge au CHU de Marrakech
En collaboration avec le Ministère de la Santé publique |
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Programme national du Diagnostic de l’Hépatite C au CHU de Marrakech – En collaboration avec le Ministère de la Santé publique
En collaboration avec le Ministère de la Santé publique |
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Participation à des missions internationales
- Antimicrobial susceptibility testing of clinical isolates of Gramnegative bacilli collected in Morocco by the ATLAS Global
- Surveillance Program from 2018 to 2020
- Journal of Global Antimicrobial Resistance 30 (2022) 23–30
- Antimicrobial susceptibility testing of clinical isolates of Gramnegative bacilli collected in Morocco by the ATLAS Global
- Evaluation of in vitro activity of ceftolozane-tazobactam in combination with other classes of antibacterial agents against Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
- New Microbes and New Infections 41:100872 - 2021
- Éducation médicale
- Projets de Recherche
- Antimicrobial stewardship
Premier centre d’excellence antimicrobial stewardship en Afrique
En mars 2022, le Centre Hospitalo-Universitaire Mohammed VI de Marrakech est devenu le premier Centre d’excellence en Afrique et une convention a été signée entre le CHU de Marrakech et la Fondation Bio Mérieux.
Un partenariat avec le laboratoire de Microbiologie dans la lutte contre l'antibiorésistance en proposant des solutions fondées sur le diagnostic et l’analyse des données. Ce partenariat vise à fournir des solutions, des compétences et des services à forte valeur ajoutée dans le cadre des travaux destinés à favoriser le bon usage des antibiotiques (Antimicrobial Stewardship – AMS) pour améliorer la prise en charge des patients.
Cette collaboration doit permettre de mesurer à travers des études et des indicateurs l’impact du diagnostic microbiologique sur la qualité des soins des patients.
Le laboratoire de Microbiologie se concentre dans le cadre de cette collaboration sur des sujets d’importance en termes de santé publique comme la lutte contre l’ antibiorésistance, la gestion du sepsis et la collaboration entre cliniciens et les professionnels de laboratoire.
Gestion de la pandémie covid-19 – région de Marrakech
Réalisations : Gestion de l’activité au sein de l’unité de Diagnostic Moléculaire de la Covid-19
- Diagnostic Moléculaire de la Covid-19 par la technique de référence RT-PCR en temps réel :- Diagnostic de la Covid-19 par les tests antigéniques sur prélèvement nasopharyngé selon les indications du protocole national .
- Diagnostic sérologique de la covid-19 :
• Mise en place au niveau de l’unité de sérologie du laboratoire de microbiologie
• Réalisation des Sérologies virales IgG anti SARS Cov-2 qualitatives et quantitatives
- Participation à deux enquêtes nationales de séroprévalence de la Covid -19 chez les donneurs de sang et chez la population générale au niveau de la Région de Marrakech :
• 2020 : 20 000 tests réalisés
• 2021 : 27 000 tests réalisés
- Gestion documentaire et Rédaction de différents documents relatifs à l’activité Covid-19.
- Mise en place du Système Management de la Qualité (SMQ) au niveau de l’unité de diagnostic moléculaire de la Covid-19 et de l’Unité de la sérologie Covid-19.
- Évaluation externe de la qualité au niveau de l’unité de diagnostic moléculaire de la covid-19, à l’échelle nationale et internationale (L’OMS).